Modelamiento proteico de la Tubulina de G. lamblia por homología de secuencias

Abstract

La Giardiasis ocasionada por Giardia intestinalis
(conocida como Giardia lamblia),
es una de las infecciones parasíticas más comunes
en todo el mundo y con mayor prevalencia
en países en desarrollo como el
nuestro. Existen muchas drogas para el tratamiento
de la giardiasis, de diferente eficacia
y efectos adversos como la curcumina
que inhibe la polimerización de los microtubulos
por un mecanismo distinto al de la
colchicina. Sin embargo, la estructura cristalográfica
de la Tubulina de G. lamblia (cadenas
α y β) permanece desconocida. El análisis
de alineamiento de secuencias (PBLAST)
indica una identidad del 86,98 y 88,32 % entre
las cadenas α y β de la Tubulina de G.
lamblia y B. taurus (PDB:5NQT). El Modelamiento
por Homología de la estructura
proteica de la Tubulina de G. lamblia utilimizando
como molde a la Tubulina de B. taurus
mediante el servidor SWISS-MODEL,
generó una estructura proteica con los siguientes
parámetros: z-core = -1,16 y -1,41,
QMEANscore6 = 0,71 y 0,70, % de confiabilidad
(de los diagramas de Ramachandran)
= 96,08 y 96,95 %, RMS (Root Mean Square)
= 0,081 y MOLPROBITYscore = 1,26. Estos
parámetros indican que la estructura proteica
de la Tubulina de G. lamblia obtenida a
partir del Modelamiento por Homología es
de buena calidad, por tanto, esta estructura
podría ser utilizada en futuras evaluaciones,
como el análisis in silico de compuestos
antiGiardia.