Evaluación de un sistema optimizado de tipificación MIRU-VNTRs para estudios de epidemiología molecular de Tuberculosis en Bolivia.

Abstract

El Programa Nacional de Tuberculosis
en Bolivia basa sus parámetros de control
en métodos de epidemiología clásica;
actualmente la Genética Molecular logra
datos precisos mediante la aplicación de
la epidemiología molecular, estudiado la
dinámica de transmisión, permitiendo conocer
fuentes y áreas afectadas en la transmisión,
mejorando la comprensión de factores
involucrados en la epidemiología de
la Tuberculosis (TB). La Mycobacteriología
molecular actualmente facilita el análisis y
comparaciones entre bases de datos por
medio de secuenciación automática.
El presente estudio pretende evaluar
un sistema optimizado de tipificación MIRU-
VNTRs (Unidades repetitivas interespaciadas
de Mycobacterias) para estudios de epidemiología molecular de Tuberculosis
en Bolivia.
Se colectaron 85 cepas de Mycobacterium
tuberculosis de 8 departamentos de
Bolivia. Se realizó la caracterización de estas
cepas, mediante PCR multiplex, utilizando
seis marcadores MIRU-VNTR específicos,
considerando los complejos A (loci
4,26,40) y complejos B (loci 10,16,31) y se
llevó a cabo la genotipificación por electroforésis
capilar. Posteriormente se evaluó
la variabilidad de genotipos entre cepas de
los 8 departamentos y se establecieron las
bases para la construcción de árboles filogenéticos
con las poblaciones estudiadas.
La tipificación de cepas de M. tuberculosis
obtenidas y la estructura genética
de las mismas, establecida a través de frecuencias
alélicas de los MIRU analizados
indica que existe una evolución independiente
de las cepas de M. tuberculosis en
los departamentos de Oruro, La Paz, Santa
Cruz, Chuquisaca y Potosí, siendo el departamento
de Oruro el más relacionado a la
cepa control (H37Rv), Por otro lado, en los
departamentos de Cochabamba y Beni, las
cepas muestran una relación evolutiva cercana,
lo que es indicio de un proceso de
migración entre estos departamentos.
El análisis filogenético basado en el
perfil de resistencia a antibióticos de las
cepas de M. tuberculosis muestra un proceso
de evolución diferencial en cada una
de las cepas evaluadas, siendo las cepas del
departamento de La Paz las más relacionadas
a las características de la cepas control.